Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA1P17096 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA1P17096 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA1P17096 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA1P17096 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA1P17096 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA1P17096 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGA1P17096 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HMGA1P17096 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGA1P17096 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGA1P17096 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms