Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN1P16949 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN1P16949 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN1P16949 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN1P16949 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN1P16949 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STMN1P16949 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STMN1P16949 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STMN1P16949 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STMN1P16949 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STMN1P16949 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STMN1P16949 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STMN1P16949 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN1P16949 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN1P16949 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN1P16949 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN1P16949 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN1P16949 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN1P16949 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN1P16949 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN1P16949 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN1P16949 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN1P16949 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN1P16949 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STMN1P16949 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN1P16949 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STMN1P16949 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STMN1P16949 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STMN1P16949 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STMN1P16949 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STMN1P16949 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STMN1P16949 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STMN1P16949 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STMN1P16949 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STMN1P16949 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STMN1P16949 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STMN1P16949 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STMN1P16949 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN1P16949 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN1P16949 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN1P16949 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN1P16949 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN1P16949 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN1P16949 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN1P16949 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN1P16949 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN1P16949 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN1P16949 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN1P16949 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN1P16949 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN1P16949 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN1P16949 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN1P16949 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN1P16949 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN1P16949 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN1P16949 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN1P16949 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN1P16949 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN1P16949 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN1P16949 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN1P16949 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN1P16949 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN1P16949 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN1P16949 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN1P16949 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STMN1P16949 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN1P16949 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN1P16949 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN1P16949 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN1P16949 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN1P16949 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN1P16949 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms