Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFD2P13995 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFD2P13995 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms