Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM225BP0DP42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms