Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBP08949 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMBP08949 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMBP08949 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBP08949 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBP08949 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBP08949 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMBP08949 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBP08949 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBP08949 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBP08949 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMBP08949 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMBP08949 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBP08949 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBP08949 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBP08949 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBP08949 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBP08949 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMBP08949 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBP08949 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBP08949 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBP08949 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBP08949 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBP08949 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBP08949 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMBP08949 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBP08949 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBP08949 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBP08949 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBP08949 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBP08949 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMBP08949 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMBP08949 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMBP08949 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMBP08949 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMBP08949 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMBP08949 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NMBP08949 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMBP08949 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMBP08949 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMBP08949 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMBP08949 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NMBP08949 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMBP08949 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NMBP08949 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMBP08949 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMBP08949 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMBP08949 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMBP08949 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMBP08949 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMBP08949 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMBP08949 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMBP08949 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMBP08949 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMBP08949 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMBP08949 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMBP08949 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NMBP08949 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMBP08949 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMBP08949 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMBP08949 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMBP08949 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMBP08949 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMBP08949 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMBP08949 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMBP08949 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMBP08949 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMBP08949 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMBP08949 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NMBP08949 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NMBP08949 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NMBP08949 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NMBP08949 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NMBP08949 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBP08949 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBP08949 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBP08949 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms