Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX6O95947 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX6O95947 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX6O95947 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX6O95947 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBX6O95947 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX6O95947 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX6O95947 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX6O95947 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX6O95947 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBX6O95947 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX6O95947 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX6O95947 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX6O95947 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX6O95947 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX6O95947 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX6O95947 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX6O95947 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX6O95947 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX6O95947 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX6O95947 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX6O95947 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX6O95947 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX6O95947 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX6O95947 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX6O95947 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX6O95947 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX6O95947 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX6O95947 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX6O95947 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX6O95947 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX6O95947 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX6O95947 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX6O95947 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX6O95947 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX6O95947 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX6O95947 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX6O95947 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX6O95947 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX6O95947 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX6O95947 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX6O95947 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX6O95947 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX6O95947 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX6O95947 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX6O95947 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBX6O95947 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBX6O95947 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX6O95947 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX6O95947 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX6O95947 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX6O95947 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX6O95947 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX6O95947 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX6O95947 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX6O95947 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX6O95947 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX6O95947 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX6O95947 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX6O95947 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX6O95947 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX6O95947 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX6O95947 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBX6O95947 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBX6O95947 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBX6O95947 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX6O95947 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX6O95947 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX6O95947 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX6O95947 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX6O95947 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX6O95947 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBX6O95947 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBX6O95947 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBX6O95947 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBX6O95947 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBX6O95947 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBX6O95947 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBX6O95947 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TBX6O95947 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBX6O95947 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBX6O95947 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms