Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSA2O95478 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSA2O95478 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSA2O95478 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSA2O95478 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSA2O95478 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSA2O95478 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSA2O95478 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSA2O95478 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSA2O95478 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSA2O95478 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSA2O95478 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSA2O95478 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSA2O95478 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSA2O95478 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSA2O95478 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSA2O95478 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSA2O95478 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSA2O95478 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSA2O95478 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSA2O95478 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSA2O95478 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSA2O95478 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSA2O95478 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSA2O95478 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSA2O95478 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSA2O95478 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSA2O95478 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSA2O95478 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSA2O95478 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSA2O95478 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSA2O95478 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSA2O95478 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSA2O95478 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSA2O95478 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSA2O95478 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSA2O95478 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSA2O95478 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSA2O95478 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSA2O95478 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSA2O95478 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSA2O95478 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSA2O95478 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSA2O95478 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSA2O95478 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSA2O95478 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSA2O95478 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSA2O95478 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSA2O95478 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSA2O95478 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NSA2O95478 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSA2O95478 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NSA2O95478 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSA2O95478 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSA2O95478 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSA2O95478 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSA2O95478 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSA2O95478 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSA2O95478 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSA2O95478 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSA2O95478 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSA2O95478 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSA2O95478 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSA2O95478 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSA2O95478 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSA2O95478 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSA2O95478 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSA2O95478 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSA2O95478 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSA2O95478 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSA2O95478 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSA2O95478 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSA2O95478 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSA2O95478 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSA2O95478 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NSA2O95478 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSA2O95478 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NSA2O95478 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSA2O95478 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSA2O95478 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSA2O95478 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSA2O95478 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSA2O95478 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSA2O95478 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSA2O95478 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSA2O95478 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSA2O95478 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSA2O95478 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSA2O95478 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSA2O95478 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSA2O95478 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSA2O95478 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSA2O95478 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms