Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX30O94993 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX30O94993 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX30O94993 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX30O94993 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX30O94993 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX30O94993 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX30O94993 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX30O94993 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX30O94993 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX30O94993 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX30O94993 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX30O94993 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX30O94993 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX30O94993 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX30O94993 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX30O94993 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX30O94993 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX30O94993 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX30O94993 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX30O94993 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX30O94993 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX30O94993 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX30O94993 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX30O94993 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX30O94993 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX30O94993 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX30O94993 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX30O94993 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX30O94993 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX30O94993 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX30O94993 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX30O94993 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX30O94993 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX30O94993 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX30O94993 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX30O94993 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX30O94993 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX30O94993 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX30O94993 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX30O94993 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX30O94993 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX30O94993 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX30O94993 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX30O94993 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX30O94993 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX30O94993 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX30O94993 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX30O94993 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX30O94993 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX30O94993 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX30O94993 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX30O94993 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX30O94993 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX30O94993 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX30O94993 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX30O94993 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX30O94993 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX30O94993 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX30O94993 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX30O94993 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX30O94993 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX30O94993 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX30O94993 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX30O94993 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX30O94993 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX30O94993 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX30O94993 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX30O94993 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX30O94993 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms