Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLIT2O94813 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLIT2O94813 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLIT2O94813 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLIT2O94813 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SLIT2O94813 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLIT2O94813 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms