Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMFO60524 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEMFO60524 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEMFO60524 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEMFO60524 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEMFO60524 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEMFO60524 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEMFO60524 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEMFO60524 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NEMFO60524 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEMFO60524 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEMFO60524 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEMFO60524 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEMFO60524 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEMFO60524 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEMFO60524 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMFO60524 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMFO60524 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMFO60524 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMFO60524 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMFO60524 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEMFO60524 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEMFO60524 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEMFO60524 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEMFO60524 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEMFO60524 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEMFO60524 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEMFO60524 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEMFO60524 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEMFO60524 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEMFO60524 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEMFO60524 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEMFO60524 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEMFO60524 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEMFO60524 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEMFO60524 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEMFO60524 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEMFO60524 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEMFO60524 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEMFO60524 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEMFO60524 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMFO60524 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMFO60524 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMFO60524 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMFO60524 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMFO60524 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEMFO60524 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEMFO60524 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEMFO60524 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEMFO60524 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEMFO60524 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEMFO60524 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEMFO60524 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEMFO60524 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEMFO60524 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEMFO60524 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEMFO60524 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEMFO60524 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEMFO60524 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEMFO60524 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEMFO60524 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEMFO60524 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEMFO60524 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEMFO60524 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEMFO60524 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEMFO60524 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEMFO60524 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEMFO60524 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEMFO60524 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEMFO60524 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEMFO60524 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEMFO60524 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEMFO60524 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEMFO60524 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEMFO60524 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms