Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNCRIPO60506 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCRIPO60506 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCRIPO60506 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms