Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT4O43236 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEPT4O43236 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEPT4O43236 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEPT4O43236 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms