Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF4O15260 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF4O15260 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF4O15260 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF4O15260 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF4O15260 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF4O15260 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF4O15260 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF4O15260 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF4O15260 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF4O15260 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF4O15260 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF4O15260 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF4O15260 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF4O15260 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF4O15260 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF4O15260 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF4O15260 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF4O15260 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF4O15260 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF4O15260 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF4O15260 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF4O15260 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF4O15260 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF4O15260 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF4O15260 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF4O15260 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF4O15260 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SURF4O15260 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF4O15260 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF4O15260 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SURF4O15260 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF4O15260 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF4O15260 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF4O15260 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SURF4O15260 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF4O15260 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF4O15260 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF4O15260 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SURF4O15260 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SURF4O15260 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SURF4O15260 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SURF4O15260 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SURF4O15260 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SURF4O15260 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SURF4O15260 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SURF4O15260 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SURF4O15260 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SURF4O15260 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SURF4O15260 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF4O15260 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF4O15260 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF4O15260 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF4O15260 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SURF4O15260 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SURF4O15260 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SURF4O15260 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF4O15260 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF4O15260 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF4O15260 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF4O15260 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SURF4O15260 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF4O15260 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF4O15260 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SURF4O15260 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF4O15260 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF4O15260 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF4O15260 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF4O15260 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SURF4O15260 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms