Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP2O15127 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP2O15127 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP2O15127 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms