Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFXAPO00287 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFXAPO00287 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RFXAPO00287 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms