Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KRW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3KRW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3KRW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3KRW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3KRW8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3KRW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3KRW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3KRW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3KRW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3KRW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3KRW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3KRW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3KRW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
J3KRW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3KRW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3KRW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3KRW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3KRW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3KRW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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