Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQ06 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQ06 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQ06 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQ06 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQ06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQ06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQ06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQ06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQ06 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQ06 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQ06 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQ06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
H3BQ06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQ06 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQ06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQ06 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQ06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQ06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQ06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQ06 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQ06 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQ06 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQ06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQ06 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQ06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQ06 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQ06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQ06 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQ06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQ06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQ06 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQ06 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQ06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQ06 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQ06 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQ06 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQ06 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQ06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQ06 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQ06 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQ06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQ06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQ06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQ06 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQ06 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQ06 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQ06 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H3BQ06 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQ06 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQ06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQ06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQ06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQ06 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQ06 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQ06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQ06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQ06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQ06 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQ06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQ06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQ06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQ06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQ06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQ06 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQ06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQ06 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQ06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQ06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQ06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQ06 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQ06 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQ06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQ06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQ06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQ06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BQ06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQ06 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQ06 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BQ06 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BQ06 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQ06 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQ06 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQ06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BQ06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQ06 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BQ06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQ06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQ06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BQ06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQ06 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQ06 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQ06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQ06 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BQ06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQ06 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQ06 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQ06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BQ06 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQ06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms