Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC169A6NNP5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC169A6NNP5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC169A6NNP5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC169A6NNP5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms