Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX4

SLC22A31, Putative solute carrier family 22 member 31, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A31A6NKX4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A31A6NKX4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A31A6NKX4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A31A6NKX4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A31A6NKX4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A31A6NKX4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A31A6NKX4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A31A6NKX4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A31A6NKX4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A31A6NKX4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A31A6NKX4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms