Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1LA6NFU8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGPEP1LA6NFU8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms