Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS37CA5D8V6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS37CA5D8V6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms