Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1B0GTW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1B0GTW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1B0GTW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1B0GTW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms