Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2E0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0B4J2E0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0B4J2E0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2E0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms