Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-3A0A0A0MS03 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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