Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPK6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPK6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A096LPK6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A096LPK6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A096LPK6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A096LPK6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A096LPK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A096LPK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms