Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PPAN-204ENST00000444703 757 ntTSL 326.7■■□□□ 1.868e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MACROD1-203ENST00000538595 868 ntTSL 326.34■■□□□ 1.818e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 PPAN-208ENST00000486482 1017 ntTSL 225.6■■□□□ 1.698e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.488e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RBBP6-211ENST00000568316 556 ntTSL 524.23■■□□□ 1.478e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 223.49■■□□□ 1.353e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.331e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-209ENST00000438253 855 ntTSL 223.07■■□□□ 1.288e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.278e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.268e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 522.55■■□□□ 1.28e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KMT5A-206ENST00000462311 747 ntTSL 522.48■■□□□ 1.191e-13■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 222.33■■□□□ 1.173e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.148e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 522■■□□□ 1.118e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 221.76■■□□□ 1.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.068e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.038e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.011e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 CCDC12-207ENST00000494655 793 ntTSL 221.14■□□□□ 0.975e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-224ENST00000584557 2000 nt20.83■□□□□ 0.928e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.925e-9■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 NOM1-208ENST00000489850 559 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.98e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CASC4-204ENST00000557945 1386 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.898e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.875e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.863e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ILF3-223ENST00000593061 475 ntTSL 320.24■□□□□ 0.835e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.835e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-204ENST00000563055 485 ntTSL 420.18■□□□□ 0.828e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.85e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-224ENST00000560615 570 ntTSL 320.02■□□□□ 0.85e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 520.02■□□□□ 0.795e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 FAM193B-211ENST00000508298 479 ntTSL 519.98■□□□□ 0.792e-11■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 EIF4G3-208ENST00000438975 1270 ntTSL 519.62■□□□□ 0.738e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.518e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 HSPD1-207ENST00000439605 578 ntTSL 417.75■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 TMC6-219ENST00000591594 614 ntTSL 317.37■□□□□ 0.378e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.358e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LTBP4-225ENST00000599225 281 ntTSL 317.14■□□□□ 0.338e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-214ENST00000558544 1399 ntTSL 517.06■□□□□ 0.325e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CPNE7-207ENST00000564421 517 ntTSL 317.05■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-201ENST00000312283 785 ntTSL 317.03■□□□□ 0.328e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-217ENST00000490700 661 ntTSL 317■□□□□ 0.318e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.318e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.38e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 216.87■□□□□ 0.298e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.293e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-217ENST00000532455 565 ntTSL 416.84■□□□□ 0.298e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-203ENST00000418022 533 ntTSL 416.71■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.278e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 316.65■□□□□ 0.268e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-211ENST00000558314 1031 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.255e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-201ENST00000260058 1431 ntTSL 216.59■□□□□ 0.258e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.248e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 516.47■□□□□ 0.233e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.228e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-216ENST00000532235 334 ntTSL 316.44■□□□□ 0.228e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RAD23A-202ENST00000586375 894 ntTSL 316.35■□□□□ 0.218e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.28e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRRT-219ENST00000641476 992 nt16.17■□□□□ 0.181e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 516.16■□□□□ 0.188e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 516.05■□□□□ 0.168e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.148e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 515.92■□□□□ 0.148e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.135e-9■□□□□ 8.1
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