RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580322.5

SAP30BP-212, Transcript of SAP30 binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene SAP30BP, Length 1,558 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30BP-212ENST00000580322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.9■■■■■ 5.9
SAP30BP-212ENST00000580322 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.31■■■■■ 4.84
SAP30BP-212ENST00000580322 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
SAP30BP-212ENST00000580322 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43■■■■■ 4.47
SAP30BP-212ENST00000580322 ABCC9O60706 1549 aa42.71■■■■■ 4.43
SAP30BP-212ENST00000580322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.61■■■■■ 4.41
SAP30BP-212ENST00000580322 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.52■■■■■ 4.4
SAP30BP-212ENST00000580322 NACADO15069 1562 aa42.18■■■■■ 4.34
SAP30BP-212ENST00000580322 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.13■■■■■ 4.33
SAP30BP-212ENST00000580322 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.78■■■■■ 4.28
SAP30BP-212ENST00000580322 SCRIBQ14160 1630 aa41.53■■■■■ 4.24
SAP30BP-212ENST00000580322 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.96■■■■■ 4.15
SAP30BP-212ENST00000580322 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.58■■■■■ 4.09
SAP30BP-212ENST00000580322 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
SAP30BP-212ENST00000580322 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.31■■■■■ 4.04
SAP30BP-212ENST00000580322 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
SAP30BP-212ENST00000580322 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.03
SAP30BP-212ENST00000580322 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.2■■■■■ 4.03
SAP30BP-212ENST00000580322 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.08■■■■■ 4.01
SAP30BP-212ENST00000580322 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
SAP30BP-212ENST00000580322 SMARCA4P51532 1647 aa39.89■■■■□ 3.98
SAP30BP-212ENST00000580322 WIZO95785 1651 aa39.73■■■■□ 3.95
SAP30BP-212ENST00000580322 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.48■■■■□ 3.91
SAP30BP-212ENST00000580322 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
SAP30BP-212ENST00000580322 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
SAP30BP-212ENST00000580322 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.24■■■■□ 3.87
SAP30BP-212ENST00000580322 SMARCA2P51531 1590 aa39.21■■■■□ 3.87
SAP30BP-212ENST00000580322 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
SAP30BP-212ENST00000580322 NCAPD3P42695 1498 aa38.94■■■■□ 3.82
SAP30BP-212ENST00000580322 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.93■■■■□ 3.82
SAP30BP-212ENST00000580322 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.91■■■■□ 3.82
SAP30BP-212ENST00000580322 HMGXB3Q12766 1538 aa38.89■■■■□ 3.82
SAP30BP-212ENST00000580322 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.71■■■■□ 3.79
SAP30BP-212ENST00000580322 TRIM41Q8WV44 630 aa38.14■■■■□ 3.7
SAP30BP-212ENST00000580322 CFTRP13569 1480 aa38.06■■■■□ 3.68
SAP30BP-212ENST00000580322 ABCC8Q09428 1581 aa38.05■■■■□ 3.68
SAP30BP-212ENST00000580322 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.9■■■■□ 3.66
SAP30BP-212ENST00000580322 PRDM2Q13029 1718 aa37.87■■■■□ 3.65
SAP30BP-212ENST00000580322 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.85■■■■□ 3.65
SAP30BP-212ENST00000580322 SYNJ1O43426 1573 aa37.71■■■■□ 3.63
SAP30BP-212ENST00000580322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.6■■■■□ 3.61
SAP30BP-212ENST00000580322 TOP2BQ02880 1626 aa37.58■■■■□ 3.61
SAP30BP-212ENST00000580322 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.57■■■■□ 3.6
SAP30BP-212ENST00000580322 NESP48681 1621 aa37.53■■■■□ 3.6
SAP30BP-212ENST00000580322 CUX1P39880 1505 aa37.48■■■■□ 3.59
SAP30BP-212ENST00000580322 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.46■■■■□ 3.59
SAP30BP-212ENST00000580322 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
SAP30BP-212ENST00000580322 SOGA1O94964 1423 aa37.35■■■■□ 3.57
SAP30BP-212ENST00000580322 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.35■■■■□ 3.57
SAP30BP-212ENST00000580322 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.34■■■■□ 3.57
SAP30BP-212ENST00000580322 EEA1Q15075 1411 aa37.34■■■■□ 3.57
SAP30BP-212ENST00000580322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.26■■■■□ 3.56
SAP30BP-212ENST00000580322 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.23■■■■□ 3.55
SAP30BP-212ENST00000580322 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.21■■■■□ 3.55
SAP30BP-212ENST00000580322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.16■■■■□ 3.54
SAP30BP-212ENST00000580322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.1■■■■□ 3.53
SAP30BP-212ENST00000580322 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.08■■■■□ 3.53
SAP30BP-212ENST00000580322 TOPBP1Q92547 1522 aa37.08■■■■□ 3.53
SAP30BP-212ENST00000580322 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.05■■■■□ 3.52
SAP30BP-212ENST00000580322 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
SAP30BP-212ENST00000580322 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.5
SAP30BP-212ENST00000580322 KIF27Q86VH2 1401 aa36.88■■■■□ 3.49
SAP30BP-212ENST00000580322 KIF21BO75037 1637 aa36.87■■■■□ 3.49
SAP30BP-212ENST00000580322 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.8■■■■□ 3.48
SAP30BP-212ENST00000580322 GOLGA3Q08378 1498 aa36.78■■■■□ 3.48
SAP30BP-212ENST00000580322 CUX2O14529 1486 aa36.77■■■■□ 3.48
SAP30BP-212ENST00000580322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.76■■■■□ 3.48
SAP30BP-212ENST00000580322 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.75■■■■□ 3.47
SAP30BP-212ENST00000580322 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.74■■■■□ 3.47
SAP30BP-212ENST00000580322 PRXQ9BXM0 1461 aa36.7■■■■□ 3.46
SAP30BP-212ENST00000580322 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.69■■■■□ 3.46
SAP30BP-212ENST00000580322 WDR97A6NE52 1622 aa36.67■■■■□ 3.46
SAP30BP-212ENST00000580322 WDR62O43379 1518 aa36.64■■■■□ 3.46
SAP30BP-212ENST00000580322 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.63■■■■□ 3.45
SAP30BP-212ENST00000580322 ERCC6Q03468 1493 aa36.63■■■■□ 3.45
SAP30BP-212ENST00000580322 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.6■■■■□ 3.45
SAP30BP-212ENST00000580322 IGF1RP08069 1367 aa36.59■■■■□ 3.45
SAP30BP-212ENST00000580322 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
SAP30BP-212ENST00000580322 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
SAP30BP-212ENST00000580322 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
SAP30BP-212ENST00000580322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.47■■■■□ 3.43
SAP30BP-212ENST00000580322 CEP162Q5TB80 1403 aa36.44■■■■□ 3.42
SAP30BP-212ENST00000580322 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.38■■■■□ 3.41
SAP30BP-212ENST00000580322 IFT140Q96RY7 1462 aa36.36■■■■□ 3.41
SAP30BP-212ENST00000580322 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
SAP30BP-212ENST00000580322 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.34■■■■□ 3.41
SAP30BP-212ENST00000580322 CUL7Q14999 1698 aa36.32■■■■□ 3.4
SAP30BP-212ENST00000580322 CLIP1P30622 1438 aa36.16■■■■□ 3.38
SAP30BP-212ENST00000580322 PBRM1Q86U86 1689 aa36.15■■■■□ 3.38
SAP30BP-212ENST00000580322 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.383e-9■■■□□ 18.9
SAP30BP-212ENST00000580322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
SAP30BP-212ENST00000580322 GRIN2BQ13224 1484 aa36.08■■■■□ 3.37
SAP30BP-212ENST00000580322 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
SAP30BP-212ENST00000580322 ADAMTS12P58397 1594 aa35.98■■■■□ 3.35
SAP30BP-212ENST00000580322 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.98■■■■□ 3.35
SAP30BP-212ENST00000580322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.89■■■■□ 3.34
SAP30BP-212ENST00000580322 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.88■■■■□ 3.33
SAP30BP-212ENST00000580322 ARAP1Q96P48 1450 aa35.86■■■■□ 3.33
SAP30BP-212ENST00000580322 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.86■■■■□ 3.33
SAP30BP-212ENST00000580322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.81■■■■□ 3.32
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