Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMC9Q9Y3B6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC9Q9Y3B6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC9Q9Y3B6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms