Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNPO2Q9UMS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNPO2Q9UMS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNPO2Q9UMS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNPO2Q9UMS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNPO2Q9UMS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNPO2Q9UMS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNPO2Q9UMS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNPO2Q9UMS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms