Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCTPQ9UKL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCTPQ9UKL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCTPQ9UKL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms