Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC13A4Q9UKG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A4Q9UKG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC13A4Q9UKG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms