Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF11Q9UIL8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms