Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK3Q9UBP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DKK3Q9UBP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DKK3Q9UBP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK3Q9UBP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms