Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGC1AQ9UBK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPARGC1AQ9UBK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGC1AQ9UBK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms