Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COPG2Q9UBF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG2Q9UBF2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms