Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B7

CFAP97, Cilia- and flagella-associated protein 97, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP97Q9P2B7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP97Q9P2B7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP97Q9P2B7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CFAP97Q9P2B7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP97Q9P2B7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms