Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCLQ9NW38 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCLQ9NW38 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms