Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNBIP1Q9NSA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms