Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF19Q9NS68 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF19Q9NS68 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms