Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC177Q9NQR7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC177Q9NQR7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC177Q9NQR7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms