Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGQ9H9S0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGQ9H9S0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NANOGQ9H9S0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGQ9H9S0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms