Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPAP3Q9H6T3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP3Q9H6T3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP3Q9H6T3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP3Q9H6T3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP3Q9H6T3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP3Q9H6T3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP3Q9H6T3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP3Q9H6T3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP3Q9H6T3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP3Q9H6T3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms