Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC86Q9H6F5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC86Q9H6F5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC86Q9H6F5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC86Q9H6F5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms