Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC27Q9C0I9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC27Q9C0I9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC27Q9C0I9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms