Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-6Q9BXR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVK-6Q9BXR3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-6Q9BXR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-6Q9BXR3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-6Q9BXR3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms