Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM2D3Q9BRN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms