Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPPED1Q9BRF8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPPED1Q9BRF8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPPED1Q9BRF8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPPED1Q9BRF8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms