Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNS3Q9BQ31 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNS3Q9BQ31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNS3Q9BQ31 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms