Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHP1Q99653 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHP1Q99653 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHP1Q99653 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms