Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMS19Q96T76 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMS19Q96T76 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms